Всё в исконных казацких традициях.
У казаков раньше (и донских, и запорожских) были и свои священники, и переносные "храмы". Причём священников выбирали сами из своих же казаков, и они не подчинялись никому, ни московскому, ни киевскому патриархам.
Так что всё по кругу....
P.S. Правда, в казаки не призывали на срочную службу, это было отдельное сословие. А может и не сословие, а народ - вычитал, оказывается зафиксировано в документах 16-17 века, что донские казаки, несмотря на то что служили московскому царю, русскими себя не считали.