А какие родные транзисторы были (маркировка)?
Защита в автомобильных усилителях в большинстве случаев защищает цепи после вторичной обмотки трансформатора БП, т.е. от к.з. в нагрузке, выходном каскаде и т.д. Входные же цепи преобразователя напряжения защищены только предохранителями. Во всяком случае, схемотехника БП подавляющего числа авто усилителей одинакова.